Б.Л. Григоренко, А.В. Рогов, М.А. Князева, Е.В. Исаева, А.В. Немухин

Моделирование механизма реакции гидролиза гуанозинтрифосфата белковым комплексом RAS–GAP

С использованием оригинальной версии комбинированного метода квантовой и молекулярной механики (КМ/ММ) исследован механизм реакции гидролиза гуанозинтрифосфата (GTP), катализируемой белковым комплексом RAS–GAP (p21^ras–p120^GAP). Показано, что предпочтительным является механизм с прямым участием Gln61 в переносе протонов и переходе Gln61 в таутомерную форму. Результаты моделирования позволяют выяснить роль ключевых аминокислотных остатков Gln61 (RAS) и Arg789 (GAP), а также роль мутаций p21^ras в функционировании комплекса RAS–GAP.

  Полный текст статьи в формате PDF

Вестник Московского Университета.
Химия 2005, том 46, № 1, стр. 19-23